结膜炎大多为接触传染，因此预防结膜炎的最主要措施是严格注意个人卫生和集体卫生，提倡勤洗手、勤洗脸，不要随便用手或者衣袖擦眼睛，对于急性期的患者要进行隔离，避免传染给他人。
如果一直眼睛患病，一定要注意防止另外一只眼睛也被传染，比如滴到患眼的眼药水不小心流到健眼，就有可能传染健眼，使健眼也得结膜炎。
对于急性期患者使用过的洗刷用品和接触过的医疗器皿，一定要严格消毒，外出回家后要好好洗手，因为公共区域比如电梯、楼道、门把手、公交车扶手等，上面可能有结膜炎患者的分泌物。