烧心和反酸是食管炎最主要也是最常见的症状，不典型的症状还有胸痛、后背痛，也有一些人表现为嗳气、胸骨后发堵、上腹痛、进餐以后饱胀感或者上腹部有烧灼感、消化不良等症状。
食管炎症状反复发作治疗不当的，还可以引起食管的狭窄，引起吞咽不畅、吞咽疼痛和呕吐等，食管炎的反流还可以出现食管外的症状，如咽部的症状，比方说咽部有异物感、咽喉疼痛、声音嘶哑等。
引起呼吸道和耳鼻喉的症状，如流涕、鼻后滴流、咳嗽、咳痰、喘息、胸闷、气短等，现在认为很多慢性咳嗽与反流性食管炎有关。