胆管癌晚期最典型的症状就是黄疸、恶病质、大量腹水、疼痛的症状，胆管癌会引起胆道的梗阻，会出现梗阻性的黄疸，呈现眼黄、尿黄、皮肤黄。晚期的胆管癌会出现腹腔的转移，从而引起大量的腹水、腹胀的症状。
晚期的胆管癌会出现侵犯周围的神经，会出现全身多处疼痛、腹痛的症状。此外，胆管癌的患者晚期因为肿瘤消耗性，会引起恶病质、消瘦、乏力等等表现，甚至更晚期的患者会出现中毒性的脑病，从而引起昏迷的症状。