对于牙周炎，漱口水的作用是辅助治疗，能够预防和减少菌斑的形成，对于牙周炎经过基础治疗之后疗效的维持和预防再次发生牙周炎，有一定的作用。目前主要用于牙周炎含漱的漱口水是复方氯己定漱口液，能够减少口腔内的细菌，并且抑制菌斑的堆积，从而防止牙龈炎症的再次复发。
复方氯己定含漱液是目前用于临床上比较常用的漱口水，如果是对于有些原因而不能刷牙或者行使其他口腔卫生的患者，采用这种漱口水也能有效的控制菌斑。