生殖器疱疹病毒现在没有彻底根治的办法，因为生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起，主要是由单纯疱疹病毒的二型感染引起，这种病毒有很特殊的本领，叫免疫逃逸功能，当人免疫力好或用药治疗的情况下，病毒会沿着神经纤维，跑到神经节里潜伏起来，用任何的药物是不能够把它给杀灭，它就潜伏着，当免疫力下降时，比如休息不好、非常劳累或者有着急的事等诱因导致的免疫力下降，就可以再次复制，并且沿着神经纤维到皮肤，引起生殖器疱疹的复发，这个病总会反复的复发，没有药物或者其他的方法把它彻底根治。
复发跟免疫力下降有关系，注意避免免疫力下降的因素的发生，就可以减少复发，使得间歇周期尽可能的延长，这比药物还要重要，注意规律的饮食作息，不要太劳累，保持比较好的情绪，才能够减少的复发，适当的锻炼身体。如果复发的非常频繁，一年发作超过4次，尤其是超过6次，可以连续吃4-6个月的抗病毒的药物，抑制复发。