霉菌性阴道炎的治疗疗程，要看霉菌复发的情况。霉菌性阴道炎是一种非常容易复发的阴道炎症，是由于本身就寄生在阴道里面的菌群出现了异常的增生所导致的。因此，如果是当抵抗力下降或者处于特殊环境下，阴道内的假丝酵母菌还会再次出现增生的现象，往往就会导致霉菌性阴道炎的复发。如果反复发作，达到每年四次以上就称为复发性的、复杂性的霉菌性阴道炎，治疗起来就会更为复杂。
霉菌性阴道炎称为外阴阴道假丝酵母菌病，对于霉菌性阴道炎的治疗，主要是采取抗真菌治疗，没有怀孕的女性，给予口服和局部用药来联合治疗。口服用药一般是给予氟康唑或伊曲康唑，阴道用药给的是克霉唑或硝酸咪康唑，一般来说一个疗程是第一天、第四天、第七天用三天，也就是间隔三天上一次，连上三次药是一个疗程。大多数女性一个疗程就可以治好，但是有一些女性的抵抗力较差或处于特殊的时期，比如妊娠期就很容易反复发作。如果反复发作需要巩固治疗半年，也就是每个月要上一次药，连续上半年，这样才算一个巩固治疗的疗程。