肛瘘是肛门直肠瘘的简称，是发生在肛周脓肿切开引流术后或肛周脓肿自行破溃、脓液溢出后的慢性炎症病变。
肛周脓肿和肛瘘是一个疾病的两个阶段，肛瘘有间歇期和发作期，间歇期会完全没有症状，这时可以不用药。发作期出现流脓、红肿、疼痛等症状，如果不能马上手术，也可以采取药物治疗，暂时缓解症状。
肛周脓肿手术超过三个月以后如果明确形成肛瘘瘘管，而且肛瘘反复发作，最佳的治疗方法就是手术。肛瘘的手术方式有很多，具体术式要根据患者具体病情决定，肛瘘复杂程度决定。
单纯切开术、肛瘘切除术，可以治疗简单性肛瘘；直肠内推移皮瓣技术、括约肌间瘘管结扎，可用于治疗复杂性肛瘘；高位肛瘘需要做高位挂线、低位切开引流术。
几种治疗肛瘘的创新手术技术已经应用，包括纤维蛋白胶、肛瘘栓、视频辅助肛瘘治疗和瘘管激光闭合术。