不同的疾病，咳痰是不同的，例如肺结核、支气管扩张、肺肿瘤可出现咳血痰，肺脓肿的患者可出现脓臭痰。不同的致病微生物感染，咳痰也是不同的，肺炎链球菌可出现咳铁锈色痰，肺炎克雷伯杆菌可出现砖红色胶冻样痰，金黄色葡萄球菌可出现黄脓痰，铜绿假单胞杆菌可出现黄绿痰，真菌感染可出现白色黏痰。
所以当患者出现咳嗽、咳痰时，我们可根据痰的颜色、气味，初步判断是由于什么疾病导致的，并作出相应的治疗。如果患者出现咳脓臭痰，我们考虑为厌氧菌感染，需要使用覆盖厌氧菌的抗生素，例如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等等。