二甲双胍是一种很好的降糖药物，一般的2型糖尿病人都把它作为首选药，但是二甲双胍确实还有一些不良反应，也叫副作用，最常见的是胃肠道的反应，譬如出现恶心、呕吐、腹疼、腹泻，也有的人会头晕，还有偏瘦的人用了以后体重有过多的降低，对瘦的病人就不太好，所以一般瘦的病人不用二甲双胍。
还有一个最近也注意到了，长期用二甲双胍的病人，有一小部分病人出现维生素B12的吸收减少，而且和糖尿病神经病变的发生有关系，所以长期用二甲双胍的病人，需要定期测定维生素B12浓度，也有的可以口服一些维生B12，像甲钴胺，这样就能预防维生素B12的缺乏。