判断是否是结肠炎，可以通过观察大便的次数、外观，以及化验大便常规来进行判断。此外，最准确的判断方式是做结肠镜检查，可以很直观的观察肠黏膜是否存在有充血、肿胀、糜烂，甚至溃疡的病变情况，必要时可以取组织病理活检，观察是否是炎症，以及判断炎症的程度。结肠炎最常见的表现是大便次数和形态发生改变，大多数表现为腹泻、腹痛、黏液脓血便，以及下腹部胀痛、腹胀等。
如果是感染导致的结肠炎，可以通过化验大便常规来判断感染的情况，必要时可以做大便细菌培养，明确感染细菌类型并做药敏试验来指导用药。如果是因为免疫功能紊乱导致的溃疡性结肠炎，最常见的表现是反复发作的黏液脓血便，迁延不愈，这种情况可以通过美沙拉嗪，免疫抑制剂，以及益生菌等进行综合治疗。