直肠息肉很少会引起患者出现不适，大部分患者在做肠镜检查时发现息肉存在，仅有少数患者会出现便血、息肉脱垂、大便习惯改变等临床症状。当息肉表面溃烂时，可以出现大便带血症状，形成黏液性血便，鲜血覆盖于粪便表面，不与其混合。
当直肠息肉合并溃疡、感染时，可以有黏液血便或里急后重感，患者表现排便频繁、排便不尽。距离肛门近的息肉可以在大便时从肛门脱出，有时仅露出肛门口。如果息肉较大，脱出肛门需用手还纳，严重者形成嵌顿，出现剧烈疼痛症状。