甲肝灭活疫苗通常是两针，初次免疫时用一支疫苗，间隔六个月之后加强免疫，再注射一支疫苗，注射部位是上臂三角肌肌肉。接种甲肝灭活疫苗可以刺激机体产生抗甲型肝炎病毒的免疫力，用于预防甲肝病毒感染。接种疫苗之后反应比较轻微，局部不良反应多为疼痛，偶有红肿、硬结，全身不良反应可出现头痛、发热、恶心等，持续的时间通常不超过24小时，一般可以自行缓解。若出现过敏反应，患者应该及时做对症治疗。
目前应用的甲肝疫苗有两种，一种是甲肝灭活疫苗，另一种是甲肝减毒活疫苗。对于疫苗中各种成分过敏者禁用，对发热的患者应该推迟应用。