女性的卵巢囊肿要根据囊肿的性质来判断是否严重，女性的卵巢囊肿分为几种情况，最常见的是生理性囊肿，生理性囊肿出现在月经的后半期，是由于卵巢的激素水平变化所形成的囊肿。
卵巢的生理性囊肿会在月经中期出现，而在月经结束后就会消失，因此判断是否是生理性囊肿，需要在月经过后进行B超检查。生理性囊肿是由于激素水平所造成的囊肿，不构成严重的后果。另外，子宫内膜异位囊肿也就是我们常说的巧克力囊肿，这种囊肿长到一定程度会造成囊肿的破裂，甚至出现急性腹痛，甚至需要手术治疗，需要进一步的追踪随访，必要时进行治疗。
其他的卵巢囊肿还包括有卵巢的浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等等上皮性的卵巢肿瘤，这样的囊肿在超声下有表现，比如囊肿内有分隔，囊内有不规则的回声，需要进一步的检查来进行判断。