艾滋病急性期腹泻可以单独出现，也可以与其它症状同时出现。艾滋病急性期症状主要是HPV病毒血症的症状，还有免疫系统急性损伤所产生的症状，通常发生在HPV病毒感染之后的2-4周，一般症状比较轻微，不经治疗1-3周之后也可以自行消失。
出现腹泻症状时，通常与其它细菌或病毒感染引起的腹泻症状相似，没有特异性。艾滋病急性期时的临床症状以发热为主，有一部分患者在急性期时并无特殊临床症状。艾滋病在急性期时除了发热、腹泻之外，可能还会出现恶心、呕吐、皮疹、关节疼痛、淋巴结肿大、神经系统症状等。但出现的任何一个症状都不具有特异性，都不能以此诊断HIV病毒感染。即便是在高危接触后出现了某些类似于急性期的表现，也不能自行诊断具体感染HIV病毒。对于艾滋病的诊断，必须是经过了疾控中心实验室艾滋病特异性的检测，此时才能够最终确诊患有HIV病毒感染。