导致房颤的原因很多，常见的原因有风湿性心脏病，风湿性心脏病累及二尖瓣导致左房结构异常，容易引发房颤；冠心病心绞痛的患者、陈旧性心肌梗死的患者心房颤动发生率明显上升，还有急性心肌梗死也会引发房颤。
高血压性心脏病累及左心房后也有可能引发房颤；甲状腺功能亢进早期，心肌有局灶性坏死和淋巴细胞浸润，容易导致阵发性心房颤动；病态窦房结综合征的患者窦房结周围变性以及窦性冲动的异常，可促使心房颤动的发生。
各类型的心肌病常因伴有局灶性的心房变性或纤维化，产生心房扩大，容易导致心房颤动的发生。目前认为，大静脉与心房肌连接处的移行细胞出现电冲动是导致房颤发生的机制。