肝内胆管结石多久会变癌并没有定论，有可能一辈子都不会变，也有可能是10-20年，具体差异极大。但如果肝内胆管结石引起了反复的胆道感染，或者引起了肝脏的萎缩、肝内的脓肿、炎症反复发作，会引起肝内胆管癌变的可能性较大。
特别是针对肝萎缩的患者，一定要及早给予手术治疗。因为肝萎缩属于肝癌的癌前病变，所以一定要早期手术切除，以预防后期癌变的风险。当肝内胆管结石数量较少，没有引起明显的症状时可以先观察，定期随访。但是在随访的过程中如果发现肝脏有萎缩，也要建议及早给予手术治疗的。