当女性患有霉菌性阴道炎时，如果有性伴侣，为了预防女性重复感染，男性也需要同时进行治疗。由于男性的症状比较轻微，甚至大部分男性都没有症状，只是一个带菌者，所以治疗起来相对比较简单。对于有症状的男性，选择霉菌的检查，可以发现霉菌阳性，男性的治疗以外用局部药膏的涂抹和口服为主。男性症状比较轻微，所以很少患有龟头炎，给予局部外用洗液加口服的药物，就可以得到治愈。口服药物主要有氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊等，需要根据医生的处方，给予合适的治疗及规范用药。
而对于有症状的龟头炎男性，可以联合局部药膏涂抹来杀菌治疗，并且缓解症状。另外，治疗期间要避免性生活，必要时可以采用工具避孕，从而起到有效的隔离细菌、互相传播的作用。