如果鼻窦炎经过规范的药物治疗，一个疗程或者两个疗程以上仍然没有治愈，鼻窦CT发现鼻窦内有息肉样物或者有真菌团块儿，另外鼻腔检查有息肉样物，需要进行手术治疗。
手术是鼻内窥镜下功能性鼻窦开放术，首先需要全麻，全麻成功以后，在鼻内镜下把有病变的息肉窦口打开，把窦腔内的息肉、脓液以及真菌团块清理干净。
清理干净以后用生理盐水进行窦腔的冲洗，检查窦腔已经干净，并且窦口打开充分，这样可以结束手术。术后需要定期进行鼻内镜的换药，定期复查。