肾结核的诊断标准需要根据病史、症状、体征，以及实验室检查和影像学检查来进行综合判断。病史就是这个人有其他部位结核的病史，最常见的就是肺结核。肺结核每年可以传染10-15个人，对于自身很可能肺结核杆菌进入血液中流经到其他器官。肾脏血流丰富，所以很容易造成肾结核的发生。
肾结核的病人容易出现尿频以及终末期血尿，做相应的常规细菌培养是不会发现的。只有做抗酸杆菌培养、抗酸杆菌DNA检测或者抗体检测才能发现，血中的抗DNA检测也是阳性的。影像学可以发现肾脏出现肾结核特有的表现，所以综合判断才能诊断肾结核。