依美斯汀滴眼液主要是用于暂时缓解过敏性结膜炎的症状，最常见的不良反应是引起眼部疼痛和头痛，另外比较常见的不良反应是引起眼部的局部刺激、视物模糊、眼睛瘙痒、眼干、角膜染色、结膜充血等，还有可能引起角膜浸润、眼内异物感、流泪增多、视疲劳等。一旦出现角膜浸润应停止用药并适当处理，极少数患者可能会出现心动过速、味觉障碍、皮疹和做噩梦等。
此药中含有防腐剂苯扎氯铵，可能会导致点状角膜病变或毒性溃疡性角膜病，因此需要对频繁或长期使用本药的患者进行密切监测。用药时应避免配戴隐形眼镜，如果滴眼时感到视物模糊，病人需等到视力清楚以后才可以恢复驾驶车辆。