胃蛋白酶原比值指胃蛋白酶原I（PGI）与胃蛋白酶原II（PGII）的比值。无论PGI还是PGII都是反映胃酸分泌的指标，胃酸增多，PG升高，胃酸分泌减少，则PG降低。但是PGII还受多种疾病的影响，因为有很多种细胞分泌PGII，不仅有胃底腺、贲门腺、幽门腺，十二指肠腺也会分泌，所以其升高也可以见于胃上皮化生及假幽门腺化生等。而胃上皮化生是癌前病变，所以二者的比值降低有可能提示存在癌前病变或癌症，但是这不是金标准，只能对疾病有一个提示作用，出现这种情况还需要进一步完善胃镜及胃镜下取病理检查，病理才能确诊是癌症、癌前病变、良性疾病。临床上常常联合应用胃蛋白酶原、幽门螺杆菌抗体检测、胃镜等诊断疾病。