导致间质性肺炎致病微生物的不同，传染性也是不同的。如果患者是由于细菌或者是真菌引起的间质性肺炎时，临床上是没有传染性的。如果患者的致病微生物为病毒，或者是非典型致病菌时，有传染性，需要进行适当的隔离。
如果患者确诊为间质性肺炎后，我们首先要评估可能感染的致病菌，需要完善血常规、C反应蛋白、支原体抗体、痰培养等相关检查。
根据致病微生物的不同，采取相应的治疗，例如病毒感染者，我们可使用抗病毒的药物，常用的药物包括了奥司他韦、阿比多尔等等。
如果患者是由于非典型致病菌引起时，我们可使用红霉素、莫西沙星等等。如果患者是由于真菌引起时，我们需要使用抗真菌的药物，例如氟康唑。