小儿喉咙发炎有疱疹，但是和手足口是不一样的。口腔疱疹是由于单纯疱疹病毒引起的口腔疱疹样变化，可以出现黏膜的溃疡、溃烂，通常手和脚皮肤不会造成损伤。
手足口病是由于柯萨奇病毒A16引起的疱疹样变化，手掌和脚底有水疱，口腔内有小水疱和溃疡，但是和儿童喉咙里的疱疹是不一样的，具有明显的差别。喉咙发炎有疱疹不会出现手掌以及其他位置的疱疹，但是手足口可以发现手掌和脚底也有水泡，所以比较容易区分。