生殖腺的位置男性和女性不同，男性的生殖腺是双侧的睾丸，位于阴囊内。女性的生殖腺是双侧的卵巢，位于盆腔后腹膜的位置。双侧睾丸通过双侧附睾、输精管，连接精囊腺和前列腺，这也是精子输送的通道。精子在睾丸内的生精上皮产生，最后在附睾内成熟，射精的时候沿着输精管、精囊腺、前列腺、射精管，通过尿道排出体外。
女性的生殖腺在卵巢内，卵巢产生卵子，成熟的卵子通过输卵管伞端，进入到输卵管当中。通常是在输卵管中与精子相遇，形成受精卵，而后进入到宫腔当中，在子宫内膜着床，而后逐渐发育成胚胎。