宝宝消化不良的时候要注意饮食，少吃多餐，多运动，有助于帮助宝宝消化。另外，宝宝在消化不良的时候，可以吃以下药物来调节肠道功能：
1、中药。中药有健脾的作用，孩子可以吃醒脾养儿颗粒、脾可欣、消食片等，有助于帮助宝宝增强消化功能，缓解消化不良的症状。
2、益生菌。宝宝如果有肠道菌群失调、腹泻，可以口服益生菌，如双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等，补充肠道益生菌有助于缓解宝宝消化不良的症状。
3、补锌。宝宝如果有消化不良、腹泻，锌的丢失比较多，可能会有缺锌的症状。锌是各种消化酶的辅酶，有助于增强消化功能，所以宝宝在消化不良的时候可以酌情补锌。
宝宝消化不良，要注意寻找原发病，针对原发病给予治疗。