藿香正气水最主要的是治疗胃肠型感冒，或者中暑引起的相关症状，一般不用于治疗咽炎的临床症状。如果出现了咽炎的症状，常见治疗如下：
1、生活方式的调理：多数考虑在平时生活中注意饮食，不要抽烟、喝酒，不要吃生葱、生蒜、辣椒等刺激性食物。同时也要注意休息，不能熬夜、不要大声嘶喊。
2、药物治疗：如果出现了临床症状，比如急性咽炎，可以应用抗炎、抗病毒的药物，如蓝芩口服液、蒲地蓝消炎胶囊。如果是慢性咽炎的症状，可以口服五味麝香丸，用开喉剑喷雾剂喷嗓子，或者用复方氯己定含漱液含漱咽腔。