间日疟的患者在起病初期并不一定表现为高热，首先通常表现为低热，伴有乏力、头疼、全身不适等前驱症状。开始发作时也不一定有规律，患者可以表现为发热不规则，但随着发作次数的增多，逐渐变成周期性的发作。
间日疟通常隔日发作一次，发作时患者首先表现为畏寒、寒战、全身打哆嗦。同时，患者可以出现口唇发绀、皮肤苍白，有头疼、肌肉痛、乏力、恶心、呕吐、上腹部不适等症状。大约持续十几分钟的时间，患者可以出现高热，体温一般可以达到39-41℃，患者寒战停止。在高热的时期，患者表现为颜面潮红，有头疼、口渴，严重的患者可以出现谵妄、抽搐，甚至昏迷。发热大约持续数小时，高温可以突然消退，表现为大汗。患者出汗后表现为困倦，有想睡觉的感觉，这个时期大约持续2-3个小时，患者的整体发作告一段落，通常隔日再发作一次。在间歇期，患者通常没有症状。