睾丸扭转的原因主要包括以下几点：
1、先天性解剖发育异常，包括睾丸鞘膜和系膜的异常，睾丸位置和活动度的异常，以及其他解剖发育异常，如阴囊过大、精索附着异常等。
2、疾病和既往手术史，睾丸肿瘤较大的精液囊肿、睾丸血肿、外伤和既往阴囊腹股沟手术史，均可增加发生扭转的风险。
3、迷走神经兴奋，睾丸扭转多发生在睡眠中或者睡眠后刚起床，约占睾丸扭转的40%。这是由于在睡眠中迷走神经兴奋，提睾肌随阴茎勃起而收缩增加，使睾丸容易发生扭转，另外在睡眠中姿势不断变化，两腿经常挤压睾丸，使睾丸位置被迫发生改变，也可能是扭转的诱发原因之一。
4、其他易感因素包括生活中提取重物时大腿的突然屈曲，在运动中的肌肉活动和受到外伤挤压和体位变化的外力影响，可引起睾丸过度活动，也容易发生睾丸扭转，睾丸扭转更常在寒冷季节发生，而在温暖地区和夏天则较少发生。