长期使用胺碘酮治疗心律失常的不良反应主要有以下几种：
1、心脏异常：一般为中度、剂量依赖性心动过缓，以及充血性心力衰竭。
2、内分泌异常：主要是甲状腺功能减退症和甲状腺功能亢进症。
3、胃肠道异常：包括良性的肠道功能异常，有腹痛、味觉异常等。
4、注射部位异常：可能有炎症反应，通过直接外周静脉给药，注射部位可能会出现浅表静脉炎。
5、血管异常：有面部潮红，还有中度和一次性血压下降。
6、眼部异常：有角膜微沉积，通常局限于瞳孔下。
7、皮肤异常：有光过敏反应，皮肤出现淡紫色或蓝灰色的色素沉着。
8、肺部异常：有弥漫性间质性肺病或肺大泡性肺疾病。
9、神经系统异常：主要包括乏力、震颤、不自主运动、缺乏协调、步态异常。
10、肝脏异常：有孤立的血清转氨酶增高、急性肝功能异常。
11、血液和淋巴系统异常：主要是凝血异常。
如果出现以上严重的不良反应，可以减量或者是停用胺碘酮。