钻牙齿的时候出现酸痛，说明钻的部分已经达到了牙本质，牙本质里的神经末梢受到了局部的冷、热刺激会出现酸痛。如果在钻牙齿的时候仅仅钻到牙釉质，不会出现酸痛，因为牙釉质里边没有神经末梢，感觉不到冷热刺激，不会引起疼痛。
如果牙齿疾病已经达到牙本质，在钻牙的时候，需要磨除部分牙本质。牙本质里面有牙本质小管，小管里面有神经末梢。在钻牙的时候，神经末梢就会受到一定刺激引起酸痛。因为在用牙钻钻牙的时候，钻的表面会产热，为了减轻产热对牙齿硬组织的损伤，在局部会喷凉水，所以热刺激和冷刺激都可以刺激神经末梢引起酸痛。