右佐匹克隆上市后的不良反应报告显示，常规使用患者一般耐受性良好，不良反应发生率低，主要不良反应表现为中枢神经系统的口苦、头晕、瞌睡、乏力等，以及恶心、呕吐等轻度消化道系统的不良反应。一般持续时间短，症状轻微，不会影响使用者的生活和功能，停药后症状就可以消失，但长期或者过量服用会增加不良反应发生的频率和程度。
如果同时服用镇静或催眠药物，可能会产生短期记忆损伤、幻觉、协调障碍、眩晕和头晕眼花。此药属于处方药，必须在医生的指导下合理使用，对此药过敏者禁用，如正使用其它药品，为防止药物相互作用影响治疗，请就诊时告知医生用药史。