盲肠淋巴瘤是多种致病因素共同作用的结果，在盲肠淋巴瘤的病因当中，研究最多，也最为肯定的是病毒的因素，已经证实部分淋巴瘤是由病毒引起的。其中Burkitt淋巴瘤与EB病毒感染有关，EB病毒可能与霍奇金淋巴瘤有关，T细胞白血病淋巴瘤病毒是成人T细胞淋巴瘤的重要病因。
除了病毒之外，免疫抑制与淋巴瘤的发生密切相关，比如器官移植的患者需要长期服用免疫抑制剂，患者淋巴瘤的发生率也明显增高，细菌感染、环境因素、免疫缺陷病或者自身免疫病也是淋巴瘤发生的重要相关因素。