治疗支气管扩张的首选药物就是抗生素，可以经验性的根据病人当地的细菌谱选择抗生素，例如可以使用阿莫西林、左氧氟沙星、头孢哌酮、头孢克肟等抗生素，根据痰细菌培养及药敏试验结果选择敏感的抗菌药物。
联合止咳祛痰药物，通常可以选择氨溴索、溴己新等药物。如果患者合并了咯血，咯血量较少时可以口服云南白药，如果咯血量比较多可以静脉给予止血芳酸、垂体后叶素、酚妥拉明等药物治疗。对于合并气喘的病人可以联合支气管舒张剂或者糖皮质激素雾化吸入，从而缓解病人的症状。