疱疹性咽峡炎是病毒感染引起主要以柯萨奇病毒感染为常见，对于病毒感染目前没有特效药，并且疱疹性咽峡炎是自愈性疾病，用抗病毒药物效果也不理想。一般情况下如果没有继发细菌感染，4-6天左右症状消失或缓解，病情严重者可能需要两周左右。对于任何病毒感染主要是对症处理如多喝温开水，症状严重时需要卧床休息，高热时物理或药物降温治疗，预防继发细菌感染及各种并发症发生。如果继发了细菌感染，或者年幼小孩需要用抗生素治疗，具体用药需要在儿科医生指导下进行治疗。