儿童鼻窦炎分为急性鼻窦炎，和慢性鼻窦炎，两者临床表现不尽相同。急性鼻窦炎，早期症状与感冒，或急性鼻炎症状相类似，但全身症状与成人比较更为明显，孩子经常会有鼻塞、脓鼻涕多。
另外，还可以有发热、精神萎糜、烦躁不安、呼吸急促、拒绝进食等表现。年龄小的患儿经常会因为不会擤鼻涕，导致黏脓性鼻涕向后，经后鼻孔流向鼻咽部，甚至流入到气管、支气管内，引起刺激性咳嗽。
刺激性咳嗽夜间更为明显，患儿有时会因为咳嗽突然惊醒。如果黏脓性鼻涕被患儿咽下，会引起食欲不振、恶心、呕吐，甚至腹泻等胃肠症状。
慢性鼻窦炎，在儿童中各种症状差别很大，经常表现为鼻塞、脓鼻涕多和咳嗽。感染重、症状持续时间长的孩子，还可以有不爱活动、精神萎靡不振、容易疲劳、记忆力差等表现。