鼻窦炎是鼻窦黏膜细菌感染引起的炎症，出现鼻腔脓涕、面部胀疼、不适感。鼻窦炎的鉴别诊断，急性鼻炎如果表现为鼻塞式样鼻涕、嗅觉减退并且有全身不适、食欲下降、头疼和发烧等症状，一般病程为7-10天。服用感冒药后症状缓解，就是急性鼻炎，并没有得鼻窦炎。
过敏性鼻炎主要是由于花粉、灰尘的刺激引发过敏反应，从而引起过敏性鼻炎，表现为鼻痒、大量清水涕及喷嚏，鼻内镜检查鼻腔黏膜苍白、水肿。也可以和鼻窦炎相鉴别，鼻息肉鼻内窥镜可以见单个或者多个苍白、半透明的肿物，不疼、不易出血，是鼻息肉不是鼻窦炎。
鼻腔的恶性肿瘤主要是因为长期鼻腔慢性炎症刺激、外伤、放疗后诱发长期吸入某些刺激性或者化学性的物质，从而导致鼻腔恶性肿瘤。鼻腔恶性肿瘤是逐渐发展的，所以也可以和鼻窦炎区别开来。