原发性的骨髓纤维化的患者，自然的病程是3-5年。原发性骨髓纤维化的患者，如果没有得到积极的治疗或者有效治疗的前提下，存活的时间是非常短暂的，大约是2-3年左右。因为该类疾病是属于一类骨骨髓增殖性的肿瘤，并且患者容易合并心脑血管以及感染性的疾病，或者出血的疾病而导致患者的死亡。
而如果一旦原发性骨髓纤维化的患者，能够积极配合临床治疗的情况下，通过羟基尿和干扰素等去控制骨髓的增生程度，同时晚期又可以用粒细胞的刺激因子，去刺激骨髓的造血功能改善粒细胞的减少，并且能通过适当的输血的方式纠正贫血，那么患者的5年生存率还是蛮高的。