PAP治疗也就是肺泡蛋白沉积症的治疗方法，最主要就是全肺灌洗，是最为标准和有效的治疗方案，巨噬细胞集落刺激因子的替代疗法和对抗巨噬细胞集落刺激因子抗体的抑制治疗，对一部分获得性的肺泡蛋白沉积症患者有较好效果，有一定的应用前景。
肺泡蛋白沉积症是一种少见的呼吸系统疾病，以肺泡和终末呼吸性细支气管内沉着着大量表面活性蛋白和脂质物质为特征，根据发病将它分为原发性肺泡蛋白沉积症和继发性肺部蛋白沉积症，对于原发性的治疗，上面所提到的对于继发性肺泡蛋白沉积症，治疗原则是治疗原发病，肺泡蛋白沉积症好发于中青年，男性的发病率多于女性，原因并不是特别清楚，可能与免疫功能的障碍有一定关系。