经阴道超声检查发现附件区有包块，不一定是宫外孕，但还是要引起重视，也有可能只是炎性包块或其它囊肿。对于宫外孕的诊断，超声检查是必不可少的检查，超声检查可以明确妊娠囊着床的部位在宫内，还是在宫外，也就是鉴别宫内孕，还是宫外孕。同时对于明确是宫外孕，还可以明确宫外孕的部位、大小，经阴道超声检查比经腹部超声检查准确率会更高。
超声检查在宫腔内没有探及妊娠囊，如果在宫旁探及异常低回声区，并且看见卵黄囊、胚芽、原始心管搏动，这种情况才可以通过B超确诊是异位妊娠。如果B超在宫腔内没有探及妊娠囊，在宫旁只是探及包块，混合回声区，但是子宫直肠窝有游离的积液，虽然没有看到胚芽、胎心搏动，应该高度怀疑异位妊娠，这种情况可以结合HCG的测定，血清HCG数值有助于对未知部位的妊娠，进一步的明确诊断。如果大于3500U/L，则应该怀疑异位妊娠存在，如果小于3500U/L，则应该继续观察一下的变化。如果HCG持续上升，复查经阴道B超明确妊娠部位，HCG没有上升、上升缓慢，可以刮取宫内膜作病理检查。