肾癌的预后最主要由组织学类型、细胞分化程度和分期决定，大多数预后较好。肾癌最常见的是透明细胞癌，其他的包括乳头状癌、嫌色细胞癌、集合管癌等。
嫌色细胞癌恶性程度低，预后是最好的；其次是透明细胞癌；乳头状癌Ⅱ型预后比较差，而Ⅰ型预后比较好；集合管癌预后很差。细胞分化程度主要使用Fuhrman分级或者WHO分级评估，一般Ⅰ-Ⅱ级比较多，预后也比较好；而Ⅲ-Ⅳ级比较少，预后也比较差。
分期最常用TNM分期，大多数肿瘤分期比较早，预后也比较好，尤其是T1期的肾癌，五年生存率可以达到90%以上；分期晚的预后差，转移性肾癌五年生存率只有30%。