由于房间隔缺损导致大量左向右分流，以致右心室接受来自左右两个心房的血液供应，右心室负荷过大出现右心室、右心房扩大，心电图出现V1导联R波增高。原发孔型缺损大多形成房室通道，左束支发生移位致左前分支发育不良出现I度房室传导阻滞及电轴左偏，若同时伴二尖瓣关闭不全则左心室也扩大。
继发孔型缺损心电图可表现为心电轴右偏、右束支传导阻滞、右心室肥厚、V1导联R波明显增高还可有I度房室传导阻滞、预激综合征等。还可出现特征性的R波切迹，在下壁II、III、aVF导联QRS波起始80ms内R波升支、顶峰、降支近顶峰出现的R波切迹，出现的导联越多诊断特异性越高。