水疱型脚气主要是在脚趾间出现了针尖大小，且比较深在的水疱，而且疱壁比较厚，不易破溃，同时伴有瘙痒、脱屑。这是一种真菌性疾病，因此在治疗上可以口服抗真菌的药，如伊曲康唑胶囊。如果患者出现瘙痒明显，这时可以口服盐酸奥洛他定片。
在外用药上，可以选择联苯苄唑乳膏和糠酸莫米松乳膏的外用。如果水疱破溃以后，局部可以应用复方黄柏洗液进行局部冷湿敷，然后将紫草油和盐酸特比萘芬乳膏交替外用。在治疗期间，可以应用红光的治疗，禁忌辛辣刺激性食物，禁忌酒，同时穿纯棉的袜子，保持鞋内清洁、干燥、卫生。