一般来说，食管的平滑肌瘤需要和发生在食管的息肉、食管的乳头状瘤、食管的血管瘤、颗粒细胞、成肌细胞瘤进行鉴别。在这些食管的肿瘤当中，无论是食管的良性肿瘤，还是食管的恶性肿瘤，都可以使病人出现吞咽困难的症状。
很多病人都可以表现为进食之后的哽噎感，开始的时候进食干的食物出现哽噎的感觉，而随着病情发展、肿瘤增大，进食半流食，甚至进食流食的时候也可以出现哽噎的感觉。要想真正鉴别食管的平滑肌瘤，食管的其他良性肿瘤以及食管恶性肿瘤，最主要的方法是取组织进行病理的检查。