毛囊炎一般来说比较好治疗，常见的毛囊炎主要还是一些细菌，比如金黄色葡萄球菌等感染毛囊的浅部所引起的一种感染性炎症。
使用内服的抗菌消炎药物以及外用药物治疗，通常是能够控制的，比如轻度的可以外用碘酊、百多邦软膏、夫西地酸软膏治疗。
严重的可以口服头孢菌素、青霉素类抗菌素，或者大环内酯类、四环素类抗菌素等，比较顽固的要做局部的细菌培养和药敏试验，指导抗菌素的选择。
但是也有一些慢性的反复的毛囊炎可能是与一些基础疾病相关，尤其是糖尿病、慢性肝肾疾病等导致机体免疫力下降，毛囊内的细菌就容易繁殖致病。
需要针对原发病积极的控制才能彻底的根治毛囊炎，否则毛囊炎就容易反复发作，不易根治。