前列腺囊肿的发生原因有先天性和后天性两种因素，这两种因素中先天性因素是主要的病因，而先天性前列腺囊肿根据其发生的部位不同，而区分发生在前列腺囊上的前列腺囊囊肿和发生在前列腺实质内的前列腺囊肿。
前列腺囊囊肿的发生率明显高于前列腺实质内的前列腺囊肿，前列腺囊肿的囊腔内常含有陈旧性的血液、脓汁、细胞碎片，没有精子，偶有纤维索状导管形成的死囊，无开口，囊腔的变化很大。
对于无症状的前列腺囊肿可以不考虑治疗，而有症状的可以考虑经会阴和经直肠的抽吸，对于较大的，可以考虑手术切除。手术的途径可以经耻骨后，可以经会阴，如果囊肿突出膀胱内，可经膀胱切除。