隐睾症属于先天性疾病，年龄越小进行治疗，越有可能治好，如果治疗晚了通常就只能进行姑息治疗。无论是单侧或者双侧隐睾，在病理上都存在退行性病变，且随着年龄增大而加重，甚至发生恶变。因此隐睾确诊后，如果出生后一年内仍然不下降，应该开始治疗。
对于隐睾，尤其是双侧隐睾，病因可能与内分泌激素有关，一岁以后可给予内分泌激素治疗。目前常用的内分泌激素有绒毛膜促性腺激素、黄体生成素释放激素，或者二类联合使用。通过激素治疗，30%-50%婴幼儿可以达到睾丸下降的目的。对于初诊时已经超过两岁，或者激素治疗无效的患者可以行手术治疗，通常是采用睾丸固定术。
需要指出的是，对于固定在阴囊内的睾丸，不能预防或者减少睾丸恶变的发生，患者仍需警惕发生睾丸癌的可能性。对于发现时已经没有功能的萎缩睾丸，如果对侧睾丸正常，患者也可以考虑进行手术治疗，切除无功能的睾丸。