绝大多数情况下增强核磁共振是相对比较安全的，对人体并没有太大的伤害，只是有一部分患者可能会出现轻度的过敏反应，或者耳部的不适，也可能有一部分患者会对密闭空间有一定的恐惧感，但是多数都不会影响检查，检查之后患者也不会持续的出现不适。
只是有少部分患者，由于既往有严重的过敏反应，有可能会出现严重的并发症，比如患者会出现各种皮下的疹子，或者心率加快、气管水肿、痉挛、血压下降等问题。也有一部分患者会出现肾脏的损伤，因为对比剂绝大多数都通过肾脏代谢，特别是肾脏有基础疾病的患者更容易出现，所以在检查前一定要告知医生自己是否有其它的基础性疾病。