低位肛瘘的手术切口比较小，而且相对比较简单，并发症也少，一般在做完手术之后半个月左右的时间，就不会影响生活，患者就能正常的排便和换药，基本上不会影响生活了，在20多天到一个月左右的时间就可以完全的长好。
因为低位肛瘘牵扯的肛门括约肌比较少，所以做低位肛瘘的直接切除术就可以，把瘘管内口、外口全部都切除。因为它不会引起肛门的失禁，所以是手术简单、切口少、并发症少的肛瘘。肛瘘也存在复杂的肛瘘，复杂的肛瘘治疗起来麻烦，恢复期也长一些。