总体来说，糠酸莫米松鼻喷雾剂的副作用非常的小，基本上没有全身的副作用，局部副作用可能有以下几点：
1、鼻腔内的疼痛感、烧灼感，甚至鼻腔局部出血、溃疡，主要好发于患者长期应用这种药物，或者喷用的时候方式不对，长期将药物喷洒在鼻中隔的表面，有可能会诱发鼻中隔利氏区的糜烂、溃烂，甚至出血。
2、患者喷用糠酸莫米松鼻喷剂的过程之中有可能会引起头疼、流鼻涕等等表现，但是非常的少见。
3、有的患者应用糠酸莫米松鼻喷雾剂之后，可能对药物本身存在过敏，导致患者出现鼻腔内的水肿，或者血管神经性水肿等等相关表现，这种情况也非常的罕见。
4、有的患者如果应用糠酸莫米松鼻喷雾剂量太大，导致药物经常进入咽部，可能会诱发患者出现咽干、咽部异物感等等咽喉炎的表现。
总之，糠酸莫米松鼻喷雾剂是一种处方药物，患者应用的时候应该在医生的指导之下，按照正确的剂量、正确的疗程进行应用。