肛瘘如果诊断明确，需要手术治疗才能治愈。影响手术愈合的因素比较多，低位肛瘘大多行肛瘘一次性切开根治术，切口开放，引流通畅，愈合时间相对较快，大约需要两周左右时间。高位肛瘘、复杂性肛瘘愈合时间也会有所延长，一般需要3-4周，甚至时间更长。影响术后愈合的因素主要有：
一、年龄，随着年龄的增加人体组织的增生、再生能力减弱，明显影响伤口的愈合速度。
二、伤口引流不畅和感染时渗出物很多，不但会影响伤口愈合，感染扩散，还会导致创面扩大。
三、熏洗不当，熏洗伤口过勤或使用药物不正确，使伤口内肉芽组织水肿、过度增生，会影响伤口的愈合。
四、糖尿病患者血糖增高，同时伴有血管病变，会影响伤口愈合。
五、心理因素，心理压力影响神经内分泌免疫系统的功能，使伤口愈合减慢。